杨涟这话其实有些淡淡的讽刺意味，不过朱由校并不在意。他加重语气说道：“朕之所以想要改变东林，是因为朕觉得，东林发展到这个样子，已经成为大明不可忽视的一股势力，朕当然可以凭皇命将他们压制，使其永远不得翻身，但朕觉得可惜了。”
在朱由校想来，党派的出现是一个很正常的现象。唐朝时的牛党李党便已经有了党派露头的端倪，虽然与现代的党派有极大的区别，但总算有了个雏形。更不用说宋朝时激烈的党派斗争，将当时的国之俊才如王安石，苏轼都卷入其中。
原来历史上东林党的形成，对于大明来说，其实并不是一个好事。因为他出现的时机，正好是大明处于内忧外患的时候，东林党想要改变皇帝独大的局面，寻求自己的声音。这必然会使得整个朝廷的内耗加剧。
东林党与皇帝斗，与别派的大臣斗，朝廷根本无法形成有效的合力。无论是对外的兵力部署，还是对内的税收改革，都有东林党掣肘的影子。所以说，明亡于东林这句话，虽然不是全对，但也其实是有几分道理的。
在紧急状态，独裁显然是最适合于一个国家的统治方式。所以朱由校登基以后，便在很多方面撇开了官集团，按照自己的意愿来做自己觉得正确的事情。这使得官集团对他的制约降到了万历以来的最低点，而这几年的形势也证明了，他的想法是正确的。
但是朱由校作为一个来自二十一世纪的新时代的青年，自然明白民主是大势所趋。从我党的二十四字真言第二句便是“民主”二字，便可见一斑。
至于如何慢慢地打下民主的基础，朱由校并没有什么好的办法，因为在后世的学校里并没有办法接触到相关的知识。但他至少知道党派的形成在民主的架构中是非常重要的，现在东林党其实已经具有了党派的一些基本特质，如果善加利用，未必就不能在大明形成接近于后世的真正的政党。
叶向高大喜道：“陛下，东林人也许有这样或者那样的毛病，但我们当初的出发点是希望能够建立一个更加强盛，更加公平的大明。如果陛下肯稍加指导，东林一定会成为陛下统治大明的最大助力。”
朱由校心想，自己可不是想要统治大明，而是想让大明人自己统治自己。当然这样说出来，会将叶向高吓倒。官虽然在竭力想要摆脱皇帝无孔不入的压力，想要发出自己对于朝政的声音，但他们还是没有想到要让大明人自己统治自己的，最多他们只觉得应该让官集团有更多的权力来对这个国家的政策进行指导，也就是所谓的精英政治，还脱不出宋代皇帝与士大夫共治天下的臼巢。
朱由校道：“指导是不可能指导的，朕说一点看法吧。其实所谓东林党，并不是因为大家有一个理论，一个目标而集结在一起的，而是因为要和其他学派作斗争，所以来抱团取暧。朕希望你们成为一个有理论，有政治看法，有施政纲领的组织，“
叶向高大惊道：”陛下，我们东林人如何可以施政？我们是衷心拥护陛下，为陛下拾遗尚可，其它并不是为臣子应该做的。“