这段时间里，科尔森的新神盾局，工作是卓有成效的，他们不仅摧毁了九头蛇企图毁灭新神盾局的阴谋，而且还跟美国政府达成了一定程度上的共识，神盾局将不会再遭受美国政府的通缉。
不仅如此，科尔森还从档案里找到了在他之前接受过gh血清的几名前神盾局探员，他们都是因为得到了绝症或者是身受重伤，在不得已的情况下接受了gh血清的治疗。
他们这些人根据脑海之中残留的外星人记忆，各自得到了不同的刻纹，而科尔森最后将所有的刻纹全部都组合在了一起，最后得到了一座城市地图，一座古老的城市地图。
新神盾局用于搜索地图所在城市的卫星网络位于夏威夷欧胡岛的卡依纳角，而那里却是由美国空军所控制，守卫森严，一般人根本无法轻易潜入，所以科尔森带着斯凯、霍普，还有菲兹一行人来到了澳大利亚。
一旦卡依纳角基地信号瘫痪，澳大利亚这处小基地的就会上线，然后他们便可以在这里进行搜索。
所以在这之前，科尔森已经提前进行了准备，他悄悄的替代了两名即将进行职务交替的军方官员的手表和纽扣，而当这两人在卡依纳角基地进行职务交替时，分开无害的手表和纽扣在这个时候，就会形成完整的特洛伊木马病毒信号，上传并将整座基地的信号瘫痪。
然而就在他们赶到澳大利亚基地的时候，却发现九头蛇的人的提前一步抵达了这里，不过科尔森他们还是很快就清除了九头蛇的人，不过战斗中霍普被人击中胸膛。
而这个时候，一个自称医生样貌粗狂的男人站了出来，如果凌霄在这里一定能够认得出他就是斯凯的父亲。
虽然斯凯的父亲做了许多的遮掩，但是他一句无心的话，却暴露了他的身份，不过他还是以崔普的性命作为要挟，顺利的从科尔森的手里脱逃，而科尔森也从他的嘴里得知了许多怀特霍尔最新的动向。
与此同时，斯凯也在这段时间里将所有的热成像和探底成像的卫星地图都下载了下来，毕竟那座城市现在并不在地表之上，而在地面之下，正是因为如此，他们才不得不跑这一趟。
事后，科尔森也告诉了斯凯他父亲曾经在基地出现过的事情，两人紧紧相距不到几百米，还有他利用受伤的崔普威胁科尔森的事，科尔森也没有隐瞒，斯凯听了之后情绪十分复杂。
之后经过对卫星地图数小时的搜索，对地球多谱地形扫描地图搜索，甚至深入海洋地壳数英里，他们终于找到了3d模型与城市吻合的古岩层，最后确定了城市所在的位置就在波多黎各首都圣·胡安市。
古老城市大部分接近地表的通风井都已经陷入了地底或者是大海中，只有在圣·胡安市的老城区还有一处通道可以通行，而他们也将从那里进入地下古城，当然，他们得先派一支测量队检测隧道结构的完整性。
而根据科尔森的计划，他们在找到神庙之后，将会直接炸毁它，但是真神盾局的那些人却有不同的意见。
凌霄对于科尔森的神庙计划并没有兴趣，神庙当中能有什么，什么都没有，那里只是方尖碑发挥效用的地方，没有方尖碑，没有神庙，没有能够触发血脉能力的异族人，凌霄很难从那里面得到什么价值。
而现在他真正感兴趣的瑞娜，瑞娜是除斯凯以外，第二个能够碰触方尖碑的人，毫无疑问，她的体内也拥有异族人的血脉，相比于被其他人牢牢守护着的斯凯，瑞娜要好下手多了！
在这段时间里，经过了凌霄改造的格兰特·沃德已经见到了怀特霍尔，尽管巴克希失踪的事情让所有人都有些紧张，但是很明显怀特霍尔并不知道是沃德将巴克希送到科尔森手上的。
而且在怀特霍尔这里，沃德见到了斯凯的父亲，经过了特殊改造的格兰特·沃德清晰的感受到了斯凯父亲心里深深压抑着的是对怀特霍尔的强烈憎恨！
正是斯凯的父亲，向怀特霍尔提供了瑞娜能够拿起方尖碑的事实，这才派出人手来围捕她。