小杰成功解放了火焰鸟，并且在无形的力量下火焰鸟决定追随小杰。而此时小杰又萌生了一个新的主意……
小灵让皇子蛇把树藤恢复了原来的样子，将被悬在高处胆战心惊的猫老大、大食花、双弹瓦斯、阿柏怪全部放生，并且在卡比兽的帮助下，几个布雷团团员被轻松的送到下一个城市——米特市的警察局，此时卡比兽已经再次系上了腰带。
神奇宝贝中心的一个休息室，小灵追问：“你到底有什么主意啊？”小杰手指放嘴唇前“嘘”了一声，把门反锁上，打开电脑，接入wifi，拨通了柳木博士的电话。没过多久柳木博士就接通了电话，打招呼说：“嘿，小杰，又见面啦！有没有继续努力啊？无事不登三宝殿，找我是不是有什么事啊？”小杰挠头说：“真是什么都瞒不过博士，那个，我抓到了一只火焰鸟……”
博士不屑地说：“耍谁啊？有的人找了一辈子都找不到它的踪迹，你才旅行三个月左右，不过是一个新人训练家而已，怎么可能这么轻易地就抓到了？你可能连火焰鸟是什么系的都不知道吧？它是……”博士还在喋喋不休地挖苦小杰，突然她就闭上嘴巴——在笑容满面的小杰背后的确站了一只火焰鸟。
博士惊讶地说：“这这这不会是真的吧……不会是你随便一只神奇宝贝套上外套伪装的吧？”小杰笑着说：“博士啊，你就这么不相信我吗？难得我还想把它给你研究呢，如果发表一篇关于火焰鸟的论文，应该无论是利益还是名气都会更上一层楼吧？所以你要不要研究一下它呢？”
柳木博士激动地拼命点头说：“你说的没错，现在网上还没有任何一篇关于火焰鸟的论文，如果我写了就是填补了这个领域的空白，成为研究火焰鸟第一人啊！我发一篇肯定是声名大振了。不过我可不相信你会这么好心，肯定不会是没条件的吧？”小杰点头说：“博士果然聪明，和您说话就是省力！我有两个条件，第一，不能在论文中提到我。”博士回答：“不用你说我也知道啊，如果提到你的话肯定会给你惹一堆麻烦，甚至会惹祸上身呢。好了，第二个条件呢？”小杰笑嘻嘻地说：“我希望，我以后抓神兽不要算一个位置，也就是说除了我身上携带九只神奇宝贝以外我可以无限携带神兽。”
博士听了以后生气地说：“你怎么这么贪得无厌啊，我不是才给你多携带三只神奇宝贝的特权吗？还想得寸进尺？”小杰嘀咕说：“那就算了，我干脆把它放生好了，反正我也不准备在洛奇联盟使用它。”博士连忙说：“别，别！虽然我不相信你好不容易抓到一只神兽舍得放生，但是没办法，我就是吃这一套，给你抓到软肋了呢。不过什么神兽不神兽的也太复杂了，神奇宝贝系统又识别不出来，这样吧，我特别批准你携带十二只神奇宝贝，这样够意思了吧？不过十二只已经是最大上限了，以后别再为难我了。”小杰嬉皮笑脸地说：“我怎么感为难我们敬爱的博士呢？”博士气得说不出话来，憋了半天说：“快点把火焰鸟给我传送过来！”
小杰摇摇头叹息了一声，研究人员从某种角度来说还真是悲哀啊，老是给人牵着鼻子走。他对火焰鸟说：“你先给博士研究一段时间吧，放心，她也是我们的朋友，不会伤害你的。过段时间我就把你取回来。”火焰鸟乖巧地点了点头，一点也没有神兽的架子，看来它已经被那股力量折服了。小杰收回了火焰鸟把它传送到博士那里了。
博士高兴地拿着火焰球说：“太好了，火焰鸟啊！”小杰说：“博士，火焰鸟我已经传送了，现在请麻烦你把耿鬼和饭匙蛇还有达摩狒狒传给我。”博士把这三只传给小杰，小杰现在身上的神奇宝贝是混混鳄、河马王、达摩狒狒、暴鲤龙、快龙、卡比兽、鲁力欧、耿鬼、哥达鸭、饭匙蛇和阿勃梭鲁11只。
小杰打开房间门，电脑放在神奇宝贝中心充电，之前那场战斗受伤的卡比兽、阿勃梭鲁、快龙、怒目鳄全部都让乔伊小姐治好了，这一切都结束以后就走出中心和小灵一起逛这个城市，小杰正咬着牙拎小灵买的那大包小包的东西，忽然一个人影窜动把小杰一下子撞倒了，小杰手中的包一下子被甩飞，摔到地上，里面买的一些东西全部都摔坏了。
小杰被撞倒都没有那么生气，反倒是小灵因为东西被摔坏骂道：“谁这么没眼力，撞了人就算了居然还害我的东西被摔碎了！”原来小杰是顺带被打抱不平的吗……然后就听到一个熟悉的声音说：“对不起啊……”小杰一看说话的人居然是……小智！“咦，小智，是你啊。”小智此时也发现了自己撞到的是小杰。小杰问：“怎么只有你一个人？小刚、小霞、小建、小遥、小光、爱丽丝、丹特他们呢？”小杰一口气说出了小智的伙伴们的名字，小智疑惑地说：“什么啊，小钢？小虾？小钢虾？是吃的还是新品种的神奇宝贝？怎么我都没听说过啊。还有什么小贱小妖小光就更不知道了。”小杰扶额说：“难道你一直是一个人旅行的吗？”小智说：“不是啊，我是有伙伴的，就是你刚才最后说的爱丽丝和丹特，上次在佛莱市你们见过的啊。不过爱丽丝现在去双龙道馆做道馆馆主了，丹特也回三洋市做道馆馆主了，所以现在只有我一个人继续旅行了。”丹特本来就是三洋市的道馆馆主自不必说，不过爱丽丝……在动画片中原双龙道馆馆主夏加的确有将馆主之位禅让于爱丽丝的意愿，但是当时爱丽丝也没给出明确的答复，现在看来爱丽丝终于还是继承了夏加的意志成为双龙道馆的馆主了？
不过奇怪了，这与动画片剧情不符啊，怎么小智没遇到小霞他们直接就遇到爱丽丝了？而且他们也是在联盟结束以后很久才分开的吧，到底是什么力量在更改剧情？这对现实世界的人来说，只是一个消遣用的游戏罢了，而所有的游戏，遇上病毒都有可能被篡改内容。
小智问：“小杰，你有几个徽章？”小杰一亮所有的徽章说：“六个。”小智兴奋地拿出徽章盒说：“那真是太巧了，我也正好是六个，不如接下来的路我们一起旅行吧？”小杰一眼看穿了小杰的心思应道：“你不会是因为丹特没在你身边，你解决不了食物问题所以才来找我们的蹭饭的吧！”小智惊讶地说：“你怎么知道！”小杰撇嘴说：“别问我，我说了也不算数，要蹭饭你得问我们美丽的厨娘——小灵。”小智心想完蛋了，刚才摔坏了她的东西她怎么肯让自己蹭饭？小智转向小灵哀求道：“小灵姐姐，你也不舍得我挨饿吧……”小灵微笑说：“我哪有那么小气，当然是没问题了，反正食物也充足得很，不差你一个人的份。”其实小灵也不是随便答应的，他的想法是购物时能多个人手帮忙拎东西也好……小杰说：“既然小灵没意见那我也没意见，不过你要加入我还有个条件。”小智有一股不祥的预感，继续问：“什么条件？”
小杰把背包放在地上说：“这是卡比兽一年份的压缩粮食，可能有点重，就交给你了。”心中暗喜，自从金刚离队以后一直是小杰来背，结果是不背不知道，一背吓一跳，这么重的东西背着多累人啊，真是辛苦金刚了。不过也没办法，总不能让小灵一个女孩子背吧？虽然小杰相信她能背起来……现在好了，小智的加入解决了这个问题。
“没……问题！”小智咬着牙背起背包，又放在地上说：“呼，太重了。小杰你刚才说你有一只卡比兽？能和我的卡比兽对战吗？”小杰摇头说：“最好不要，你不知道我的卡比兽有些特殊，而且看到是同类对战起来可能会更加亢奋伤到你的卡比兽就不好了。”的确，要是小杰的卡比兽兴奋起来把腰带解开估计全力一击可以把小智的卡比兽连鼻涕泡带血一起打出来。
小智很失望地说：“这样啊，那太可惜了……”小杰笑着说：“虽然如此，但来一场战斗还是没问题的。来一场双打比赛如何？”其实小杰也很想和小智对战一场，他早就想和小智一较高下了，小智是他童年以来的偶像，他现在的确想知道自己和心中的偶像究竟还有多少差距。小智一下子又兴奋起来了：“太好了，就这样！我燃起斗志了！”小杰说：“别着急，这里不适合战斗，我们换个地方。”
几个人找到了一片开阔的空地，小智和小杰距离拉开，小杰抛出两个神奇宝贝球说：“拜托你们了，混混鳄，耿鬼！”小杰第一次使用耿鬼，收服以后一直没让它战斗，这次终于出场了！小智丢出一个神奇宝贝球说：“去吧，顿甲！”哦，是顿甲啊，这只在小智的神奇宝贝里面算是很强的一只了。小智只丢出一个神奇宝贝球，不出意外的话另一只就是……果然，小智右手食指向前一指说：“就决定是你了，皮卡丘！”皮卡丘欢快地叫了一声“皮卡”以后从小智肩膀上跳了下来。