上回说到轩辕危急，崆峒印出现，承载人族气运，有龙凤合鸣异象……
盘古肉身一拳之下，真龙哀鸣，凤凰泣血，崆峒印遍布裂痕，黯淡无光，掉落在地上。
当然，崆峒印也不是什么作用都没起到，最起码为轩辕争取到一丝时间。正是这一丝时间，将要逆转的定局便出现变数。
只见元始天尊头顶庆云金灯，手持中央戊己杏黄旗挡在了巨拳之前。元始庆云金灯垂珠璎珞，金花万朵，络绎不断，远近照耀。玉虚杏黄旗垂下金莲万朵，却被这一拳打得混乱不堪，金莲幻灭。
这次的都天神煞大阵没有祖巫主阵，却有阵旗相助，召唤出的盘古肉身比第一次时稍弱，但也有圣人初期的实力。元始成就混元圣人之尊数个元会，虽进步不大，但也能发挥出全部的实力，不像这盘古肉身，空有一身战力，却发挥不出来。
盘古见自己一击未能建功，大怒，目射都天神雷。元始祭出盘古幡，一划，混沌剑气与神雷相撞，两相泯灭。盘古似是感应到什么，神情微变，伸手一握，竟直接将元始手中的盘古幡夺去。
盘古手握幡旗，当做斧头竖砍。元始神情不变，却见太清圣人坐骑青牛，头顶玄黄玲珑塔，垂下无尽玄黄之气护住了元始。玄黄玲珑塔不愧是后天第一功德至宝，防御无双，只是微晃便挡住了盘古幡的攻击。
这时，盘古肉身一阵虚幻，重新化作十二面黑色大旗。阵旗直接卷起脸色惨白，伤痕遍布，早已昏迷地不省人事的蚩尤欲要遁去。元始则伸手召回盘古幡，顺手一划，混沌剑气击在都天神煞阵旗之上。
却见蚩尤从中掉落，跌落在地上，阵旗则划破虚空进入了冥界。众人跪拜，口呼圣人大德，元始和老子却没有理会他们，直接离去。
正此时，有朗朗的读书声从远方传来：“天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物……”
浩然正气大盛，冲散煞气、杀气、劫气，为众人治疗伤势。即使只是圣人之战的余波，也不是在场这些人能够承受的。群仙伤势渐愈，纷纷起身向孔宣拜谢，人族则继续跪拜先师。
一番见礼之后，轩辕擒拿蚩尤，进驻九黎城。在九黎城中，一番休整之后，轩辕祭拜人族英灵以告天下。祭文读毕，便是斩杀恶首蚩尤。
蚩尤虽然修为被封，但肉身依旧强横，普通神兵不能伤。尤其是经过此次召唤盘古肉身之后，九转玄功更是进入了第七转后期，几近不死之身。即使是轩辕以圣道金剑斩之亦收效甚微，不过片刻便自行恢复。被缚的蚩尤大笑不止，嘲讽轩辕无能。
轩辕大怒，圣道金剑高举，高声道：“苍天有眼，今轩辕欲以此圣道之剑斩杀恶首，恭请天地诸神助我！”
洪荒星空，星辰战岛，太阳神殿之中，伸手一弹屠巫剑，一道剑光落入洪荒。轩辕言罢，便见异象显现，白日现星斗，一道星光注入轩辕剑中。轩辕连斩五剑，砍下蚩尤的四肢和头颅。蚩尤虽被斩作六段，但仍不死，叫嚣着轩辕无能。
孔宣微笑摇头，对轩辕说道：“便由我将蚩尤道友封印在五岳神山之下吧！”
轩辕正为此烦恼，闻言大喜道：“有劳先师了。”
至于那虎魄刀，轩辕欲以圣道金剑斩之。只因神兵有灵，竟自行划破虚空，穿过东胜神州与北俱芦洲之间的一座界门，遁入不见。人皇之争前后持续千年，至此完全落幕。
群仙见大局已定，大劫也已落幕，便纷纷告辞离去，各自回了洞府静诵黄庭。女魃回了昆山继续潜修，玄女则回了天庭复命，素女却留在了轩辕身边。
孔宣小住九黎城几日，看到轩辕对九黎族人一视同仁，甚是欣慰，鼓励告诫一番后离去。
孔宣将蚩尤的四肢与身体分别封印镇压于五岳神山之下，头颅则抛向了东海外。之后回到北冥逍遥岛上，拜见父亲，将三点盘古元灵融入盘古神像之中。至此，逍遥已得十八点盘古元灵，据有半数之多。
人族，轩辕一统天下，下令各个部落首领会盟于东岳泰山。祭天盛典，泰山封禅，人族气运汇集，被盘古肉身一拳打裂的崆峒印复原，大放神光。
随着轩辕的一系列政策措施颁布推广，人族大治，日益强盛。
后来轩辕又在人教教主的撮合下与西陵大部落的首领西陵氏之女成婚，是为天地人三婚之人婚，至此婚嫁制度完善。