江南制造局重新恢复生产，也是华东政府将上海作为迎战英法远征军的前沿港口基地的重要条件之一，因为只有上海地区具备军舰的基本维修能力，才有条件做为华东政府前沿港口基地，迎战英法远征军。否则连给军舰做个全面检修都要把船拖回青岛去，这样的前沿港口基地也就没有任何意义了。
登陆日本作战和爪哇撤侨是同时进行，因此海军的舰队也将分成两批，分头行动。
爪哇撤侨行动实际还有引出英国的远东舰队决战的目地，因此分配的军舰实力也较强，将出动5艘战列舰，包括最新的干将号、莫邪号，和威洋号、博洋号、飞洋号三艘，除了还不具备实战能力的敷洋号之外，这5艘战列舰确实是人民军海军中最强的军舰了。
英国的远东舰队共有8艘战列舰，包括6艘老人星级和2艘百夫长级，不过百夫长级属于2等战列舰，战斗力并不强，而老人星级是威严级的简化改进型，虽然保持了威严级的武装，但削弱了装甲，只是增大了续航力。
从总体来看英国的远东舰队虽然拥有8艘战列舰，但实力并不强，和华东政府现在的8艘战列舰相比，明显是落入下风，虽然大英帝国的海军有逢敌必战的传统，但如果敌方的实力过于强大，又并不是非战不可，也不会轻易出战，因此人民军只出动5艘战列舰，就是让英国远东舰队认为自己有一战之力，而主动出战。人民军海军则可利用这个机会，重创英国远东舰队，也是在远征军到达之前，先削弱远征军的部分力量。
而爪哇撤侨舰队除了战列舰之外，还出动济南号、天津号两艘装甲巡洋舰，以及青州号、沂州号两艘大型防护巡洋舰，和第1、4巡洋舰分队，第1、3驱逐舰分队，以及16艘运输补济舰。
旗舰是穿越军舰中的岳阳舰担任，这次爪畦撤侨行动的总指挥官则是由王海龙担任，如果和英国远东舰队交战，岳阳舰并不参战，而是为参战的军舰提供射击单元指引。这主要是因为舰队的实力足够，无需要穿越军舰参战，另外也是让海军积累作战经验。
相对来说登陆日本作战的舰队就要弱得多，主要是远洋号、瞭洋号两艘战列舰，以及4艘镇远级铁甲舰。毕竞现在日本舰队的实力己经很弱了，战列舰一艘都没有，主力只是两艘装甲巡洋舰，因此登陆日本作战主要是方式还是两栖登陆作战，海上舰队作战基本不会发生，军舰的作用主要是为登陆部队提供护航和火力支援。
远洋号、瞭洋号虽然也是战列舰，但在原设计上就存在着很大的缺陷，舰龄都超过了15年，早己经是过时的型号，以前是因为海军就只有这两艘战列舰，还不得不把两艘大型装甲巡洋舰拉进来凑数，因此也只能说是对付着用吧。但现在连自造加俘虏，己经有了8艘战列舰，那么这两艘战列舰自然就可以退居二线。
不过作为对岸轰击的火力支援军舰，这两艘军舰到是合格的，因为这两艘军舰均安装了三座双联装280毫米主炮，本来首尾的4门主炮是35径倍距，中间的2门主炮只有30径倍距，因此6门主炮不能使用相同的射击单元，但华东政府在改造这两艘军舰时，在前后主炮均换装成30径倍距，这样虽然威力有所下降，但可以使用同一射击单元进行齐射，实际的作战效率反到得到了提升。
如果说远洋号、瞭洋号还能说是差强人意，那么4艘镇远级铁甲舰则完是最后一点剩余价值，本来这4艘军舰都己基本到了退役的年限，已经下放到了预备役中，只是华东政府出兵参战，正是用舰之际，因此才将这4艘军舰又重新编入现役，并划归给海军陆战队使用。不过这4艘铁甲舰当海上的浮动炮台，还是可堪一用的，在此前华东政府的三次登陆作战中，均发挥了应有的作用。
当然，这6艘军舰可以完成火力支援的任务，护航就有些力不从心了，虽然火力、装甲尚能一战，但航速太慢，远洋号、瞭洋号只有16节，而4艘铁甲舰连12节都有些免强，而日本还有两艘装甲巡洋舰，航速都在20节以上，因此海军将刚成立的第2装甲巡洋舰分队拔给登陆舰队，它们既使参与对岸轰击、火力支援，也能为登陆舰护航。
另外还有第5、6巡洋舰分队，第2、4驱逐舰分队，以及8艘登陆舰，8艘运兵舰。而穿越军舰将出动两艘，为襄阳舰、怀化舰。